نرم افزارهای مدل سازی مولکولی-Molecular modelling

[ShapoorII]

تو این تاپیک قراره نرم افزارهای کامپیوتری مختلف در زمینه مدل سازی ساختارهای شیمیایی ر معرفی و بررسی کنیم.
برنامه های خیلی زیادی با مزایا و معایب و قابلیتهای مختلف ارائه شدن ک استفاده از اونها توسط دانش پژوهان باعث یادگیری و درک بهتر میشه و پیش بینی خواص و ساختار مولکولها ر امکان پذیر میکنه.


فعلن 3تا از معروفترینا ر معرفی میکنم و توضیح کوتاهی م میدم. اگ خوب استقبال بشه و دیگران م همکاری کنن و نیاز باشه برنامه های عال ر تو تاپیکهای جداگونه بررسی میکنیم.

پکیج ChemBio Office: شامل Chem 3D , Chem Draw و چنتا برنامه جانبی: ChemScript و ChemFinder
Chem 3D: بیشتر برای مدل سازی مناسبه هرچند میتونه محاسبه دینامیک مولکولی ر انجام بده اما نتایج بدست اومده قابل اعتماد نیستن. قابلیت ذخیره فرمتهای عکس(jpg , bmp,...) یکی از مزیتاشه از اینجامیتونید برنامه ر دانلود کنید.

HyperChem: ویژگیهای Chem 3D ر تو سطح پایینتر داره و البته حجم برنامه خیلی کمتره. یکی از مزیتاش وجود نسخه های برنامه وا3 سیستم عاملای غیر از ویندوز مخصوصن ios ـه ک امکان استفاده از اپلیکیشن با آیپد و آیفونُ فراهم میکنه. در واقع دسترسی بهتری بهش هست.

Gaussian: این یکی فقط محاسباتیه، ساختارای طراحی شده با Chem 3D ر ایمپورت میکنین و برنامه خواص ترمودینامیکیشُ پیش بینی میکنه، خیلی دقیقتر از هایپرکم و کم تری دی



HyperChem ر میشه ساده ترین برنامه با قابلیتهای جامع دونست، پس از این برنامه شروع میکنیم